《命令与征服 3：凯恩之怒》填补了先前游戏中的一些不足之处。其故事情节跨越了整整 20 年——从第二次泰伯利亚战争后 NOD 兄弟会的重生到第三次泰伯利亚战争以及之后的事情。

本资料片的一大特色为“子阵营”的出现，三大势力重新细分为九种不同特色的参战阵营，交战各方包含了初始阵营及两种不同特色的新增阵营，并配合子阵营的独特军备给予玩家莫大的战术优势及弹性。