一代故事结束后仅仅一个月，样本复制品就扩散到四面八方，导致无辜市民陷入混乱：通讯中断、政府解体，军方更是被彻底消灭。欧洲民众非常了解求生自保之道，幸运的幸存者们躲进掩护中企图活命。

还有人抱持着一丝希望……市民和佣兵成群结队，共同面对爆发的感染潮，并在欧洲各处建立拥有私人资助的作战基地。在追踪样本复制品的途中，玩家会进入 zed 遍布的禁区，将它们尽数消灭。