《漫威 VS 卡普空：超级英雄的冲突》是卡普空的第五个漫威漫画授权的格斗游戏，也是漫威 VS 卡普空系列的第三个游戏。与《X-Men vs. Street Fighter》和《Marvel Super Heroes vs. Street Fighter》不同的是，该游戏中的人物来自卡普空的众多系列项目，如 Mega Man 和 Strider，而不仅仅是街霸人物。游戏发生在漫威漫画的连续宇宙中，查尔斯·泽维尔教授呼吁英雄们在他与万磁王的意识融合之前阻止他，并成为被称为 Onslaught 的存在，即最后的 Boss。

这个故事情节松散地基于《X 战警：Onslaught》的漫威漫画连续剧……显示全部：在一次变种人心灵感应者查尔斯·泽维尔被迫进入万磁王的大脑的事件之后，万磁王的部分愤怒滑入泽维尔的心灵，在与泽维尔最黑暗的情绪融合之后，产生了一个强大的精神实体，被称为冲锋陷阵。游戏通过让泽维尔的良心呼唤卡普空宇宙中的英雄来帮助阻止他，从而扩展了这个故事。