多年后的未来，人类终于发现了外星生命。为了与这些外星文明建立联系，人类建造了一座名为“和平号”的空间站。然而，和平号却神秘消失，所有搜寻尝试均告失败。三年后，空间站上一名乘员的儿子与来自 FM 星球的外星生命体相遇——这位名为 Omega-Xis（简称 Mega）的外星人与少年星河大地（Geo Stelar）联手，开启了探索地球隐藏“电波世界”的冒险，并由此诞生了新的英雄：洛克人（Mega Man）。

《流星洛克人》是一款融合动作与角色扮演要素的游戏，其风格延续了《洛克人 EXE》的设定。玩家将扮演星河大地，在地球的现实世界中自由探索。地球上的所有设备都通过称为“电波世界”的无线网络传输……显示全部数据并进行交流。与 Mega 融合后，大地可以变身为洛克人，进入电波世界，击退病毒、修复机器，并读取他人 Transer 设备中的隐藏信息（Transer 是人们用于通讯的数据终端）。

由于 Mega 是来自 FM 星球的逃亡者，他被其他 FM 星人追捕。这些敌对的外星生物也会陆续降临地球，引发各种骚乱，而洛克人必须挺身而出予以应对。战斗将在上屏以第三人称视角进行。每回合开始时，玩家可选择攻击卡片进行战斗，这些卡片提供强力的攻击或防御效果。战斗中，洛克人可以左右移动躲避攻击，也可使用护盾格挡大部分伤害。战斗结束后，玩家会根据表现获得金钱、回复道具或新卡片作为奖励。

游戏的一大特色是“兄弟连线（Brother Band）”系统。通过与他人建立兄弟关系，你可以借用对方的卡片与能力，提升自己的战斗力。你可以在游戏中与虚拟角色结为兄弟，也可以通过任天堂 WFC 或本地无线与现实中的朋友连接。游戏中期还可解锁“龙之卫星”的力量，进一步强化洛克人。此外，你也可以与持有其他卫星版本（如狮子或天鹅）游戏的朋友联机，借用他们的力量。