少年主人公因某个理由，转入位于港区港湾人工岛的月光馆学园高中部就读。
在他入住学生宿舍几天后，遭到了神秘怪物袭击。
在怪物袭击之下，少年意外的使潜藏的心灵力量“人格面具”觉醒，
并加入了由同样拥有人格面具能力的人所组成的组织“特别课外活动部”（S.E.E.S.），
和伙伴们一同面对世界发生的谜团……

《女神异闻录３》这款作品是超人气《女神异闻录》系列作的转折点，现在经由 P-STUDIO 之手大幅翻新，于现行最新游戏平台上重新复苏。

本作品保留了原作剧本与登场角色等游戏基础，并对游戏整体进行了许多细部调整，
其中包含提升游戏操作性与介面更新等等。游戏系统变得让玩家更易于游……显示全部玩。
图像表现则对应 4k・60fps 现行最新游戏平台的硬体功能，角色 2D 绘图、3D 模组、背景设计、UI 等所有视觉要素全部变得更加美丽。
此外也追加了角色的支线故事与搭话时的台词、语音场景。包括开场影片在内，作品里的动画也全部重新制作。以更加鲜明的表现方式为玩家们带来《女神异闻录３》的“那份感动”。