西元 2014 年。东京，新宿。
日本是个认定阴阳师为职业的国家。
东京未曾经历过大空袭，第二次世界大战也已然落幕。
整个世界新旧事物交错。
在本该洋溢平和气氛的日常生活中，妖怪危害人类的事件却层出不穷。

被选中解决这项问题的，是终战当时才刚刚被允许信仰的阴阳道――也就是阴阳师。

世界正逐渐被混沌吞噬。
虚无缥缈的灵魂徘徊着，飘荡在东京之中。
人们发现受到不良影响的妖怪，竟是由人类变化而成。

解决以许多意念交错的这片土地为舞台而引发的诡异事件，一步步逼近真相。