《X-COM：来自深海的恐怖》是《X-COM：未知敌人》资源管理和战术战斗游戏的后续。

自从 X-COM 上次击败外星人以来，已经过去了 40 年。现在，在 2040 年，外星人又开始出现在地球上。这一次，对人类的威胁来自海洋深处。

这款游戏与原来的 X-COM 游戏几乎完全相同。用户界面、武器和外星人都是一样的。唯一的区别是外星人和武器（如新的徒手武器）对海洋环境的适应性。游戏有海底和陆地任务，而且难度明显高于前作。